Misimović je rođen 5. juna 1982. godine u Münchenu, a u mlađim uzrastima nastupao je za SV Nord Lerchenau, TSV Forstenried, SV Gartenstadt Trudering, FT München Gern i Bayern.

Potom je prešao u drugi tim Bayerna, gdje je u periodu 2000. do 2004. godine odigrao 102 utakmice uz postignuta 44 gola. Za prvi tim Bayerna odigrao je samo tri utakmice.

Pravu priliku Misimović je dobio 2004. godine, kada dolazi u VFL Bochum, gdje postaje standardan igrač, te u 92 utakmice postiže 21 pogodak. U Bochumu je igrao do 2007. godine.

Nakon Bochuma prelazi u 1. FC Nürnberg gdje je u sezoni 2007/08 odigrao 28 utakmica i postigao 10 golova, da bi 2008. godine prešao u VfL Wolfsburg.

To je vjerovatno period kojeg se svi Bosanci i Hercegovci rado sjećaju. Sa Wolfsburgom je 2009. godine osvojio njemačku Bundesligu, te bio najbolji asistent lige, a uz Edina Džeku svakako i jedan od najvažnijih igrača Vukova u toj sezoni. Kasnije je igrao i za Galatasaray, Dinamo Moskvu i Guizhou Renhe.

Što se tiče reprezentativne karijere, prvobitno je nastupao za U-21 selekciju SR Jugoslavije, odigravši samo jedan meč.

Za A reprezentaciju Bosne i Hercegovine debitovao je 18. februara 2004. godine na prijateljskoj utakmici protiv reprezentacije Makedonije, a svoj prvi gol u dresu reprezentacije postigao je 12. marta 2004. godine na prijateljskoj utakmici protiv reprezentacije Luksemburga. Za Zmajeve je odigrao 85 utakmica i postigao je 26 golova.

Da je ostavio dubok trag u njemačkom bundesligašu potvrđuje i video koji svake godine objavi Wolfsburg. 

Tako je i jutros na svom Twitteru objavio video sa asistencijama genijalnog Misimovića iz šampionske sezone 2008/09.