Mujkić će dugogodišnju karijeru okončati tamo gdje je i počeo - u Budućnosti iz Banovića.
On je 2005. godine iz Budućnosti prešao u bihaćko Jedinstvo, gdje se zadržao do 2008. godine, odakle se vratio u Tuzlanski kanton i stao na gol Slobode. Među stativama Tuzlaka bio je do 2012. godine, a onda odlazi u Novi Pazar gdje se zadržao sezonu.
U Budućnost se vratio 2013. godine i više nije mijenjao sredinu.
Mujkić je četiri puta pozivan u reprezentaciju Bosne i Hercegovine.
- Nedjeljna utakmica protiv Bratstva je posebna za svakog navijača Budućnosti, nedjelja je dan kada se od aktivnog igranja fudbala oprašta naš kapiten Denis MujkiĆ.
- Kapiten je za naš klub odigrao preko 30.000 minuta, sada mi izdvojimo 90 za njega i dostojanstveno ga ispratimo i zahvalimo mu se za sve što je učinio za Budućnost. Također smo odlučili da dresove u kojima se bude igrala ova utakmica igrači bace navijačima i tako ih nagrade za podršku koju su im pružali tokom cijele sezone - saopćeno je iz Budućnosti.