Prema saopćenju Ministarstva odbrane Azerbejdžana, u skladu sa sporazumom o prekidu vatre koji su uz posredovanje Rusije potpisali Azerbejdžan i Armenija, azerbejdžanska vojska je ušla u Agdam.

Oko 77 posto ukupne teritorije Agdama 1993. godine je okupirala vojska Armenije. Zbog okupacije, svoje domove je tada napustilo oko 200 hiljada Azerbejdžanaca. Centar Agdama i okolna sela su nakon okupacije opljačkana i porušena, a većina objekata je te 1993. godine pretvorena u ruševine.

Nakon što je vojska Azerbejdžana 27. septembra pokrenula operaciju s ciljem oslobađanja Nagorno-Karabaha, od armenske okupacije je oslobođeno pet gradova, četiri manja mjesta i 286 sela, što je dovelo do kapitulacije Armenije. U sklopu sporazuma o prekidu vatre Armenija je pristala i da Azerbejdžanu vrati Agdam, Lacin i Kelbecer.